Di Kyoto 2027, pemerintah Jepang membuat rencana mengumpulkan dan melestarikan arsitektur dan budaya alami kota melalui drone yang secara real time, menyimpan datanya dalam mesin berkapasitas tidak terbatas dikenal Alltale. Naomi Katagaki siswa sekolah menengah tinggal di Kyoto. Suatu ketika usai sekolah, seorang yatagarasu misterius mencuri buku perpustakaan miliknya dan dalam usaha mendapatinya kembali, dia bertemu seorang pria aneh muncul entah darimana.
Pria ini hanya bisa dilihat Naomi, dinyatakan sebagai dirinya sendiri sejak 10 tahun selanjutnya, kini telah dewasa. Naomi dewasa menjelaskan dia telah mengakses Alltael dari dunia nyata di luar guna mengubah masa lalu dan menyelamatkan calon pacar Naomi yaitu teman sekelasnya Ruri Ichigyo, usai dia disambar peti di festival kembang api dan membuat koma.
Remaja Naomi memutuskan menyebut dirinya dewasanya Sensei dan setuju membantu, sebab diri dewasanya mempunyai kemampuan terbatas sebagai avatar di dalam Alltale. Sensei memberi Naomi kekuatan khusus, yang bermanifestasi dari yatagarasu sebagai tangan bersarung tangan tembus cahaya, untuk memungkinkannya menciptakan apapun selama struktur kimianya dan juga fisiknya tidak rumit.
Mengonsultasikan diary sendiri, Sensei membuat Naomi perlahan mendapati kasih sayang Ruri dan mereka pada akhirnya jatuh cinta. Di malam kejadian, Naomi menolak mengundangnya ke festival dan tetap berada diluar rumahnya terhadap perintah Sensei. Mereka menyadari karena ini dunia di dalam Alltale, campur tangan Sensei usai mengakibatkan Sistem Homeostatic untuk masuk.
Bot dalam bentuk pria Kitsune yang tampak berusaha memperbaiki data, membawa Naomi dan Rui ke lokasi kejadian. Memanggil black hole, Naomi tidak hanya menghapus orang Kitsune, namun juga sambaran petir akan mengenai pohon yang seharusnya ditunggu Ruri dan oleh karenanya kecelakaan, berhasil menyelamatkan Ruri dan juga menulis ulang data.
Sensei seketika mendapati kembali God Hands dan memindahkan Ruri sebelum menghilang. Naomi terkejut saat dia menyadari rencana sensei merupakan menciptakan kembali kondisi mental asli Ruri di Alltale alhasil data didalamnya bisa disinkronkan dengan pikiran koma Ruri sendiri dunia nyata, memungkinkannya untuk bangun.
Kembali, dikalahkan, menuju kota, Naomi seketika dihadapkan ribuan pria kitsune, efek dari Sensei memutuskan me-reboot sistem usai semua data relevan dengan keberadaan Ruri ditulis ulang. Sistem secara otomatis memfilter bagian data untuk disimpan dan juga yang akan dihapus, mengakibatkan ruang dalam 2027 Kyoto bergeser dan aurora merah muncul dilangit.
Naomi mengingat bagaimana Ruri diteleportasi dengan cara sama, melompat menuju ke kemerahan. Dia bangun dalam ruang virtual menuju yatagarasu, meyakinkan dia bahwa dia tidak mati dan juga berjanji membantunya menyelamatkan Ruri, memanifestasikan God Hands untuknya sekali lagi. Sementara dunia nyata, Sensei memeluk Ruri, terbangun dari koma.
Pria Kitsune segera hadir di sekitar ruangan yang menargetkannya, Sensei menyadari dunianya juga dunia di dalam Alltale. Remaja Naomi membelok menuju kamar rumah sakit Ruri dan juga bersiap membawanya ke tangga diluar kompleks Alltale, yang mempunyai koordinat spasial optimal untuk mereka guna kembali menuju dunia asli mereka.
Melalui bantuan Sensei, mereka kabur berlari lebih cepat dari orang-orang Kitsune, Ruri kembali menuju waktunya melalui portal yang dibuat God Hands. Orang-orang Kitsune, mengalihkan target mereka menuju dua Naomi, berubah menjadi makhluk raksasa mengerikan mengalahkan kekuatan Naomi.
Di saat terakhir, Sensei mengorbankan dirinya, mengetahui hanya ada satu Naomi dan berterima kasih terhadap dirinya di masa lalu sebab membiarkannya melihat Ruri tersenyum lagi. Di dalam Alltale Management Facility, Alltale mampu dimatikan usai datanya rusak dan menduplikasi dirinya.
Sistem Logika Alltale dinonaktifkan yang memungkinkan dunia paralel terjadi dalam Alltale. Dengan menangis, Naomi kembali menuju Ruri. Karena data usai ditulis ulang tanpa bisa dikenali, Naomi menyambut dunia paralel dihadapannya dan Ruri.
Pasca credit, Naomi dewasa terbangun diatas peradaban manusia di Bulan, dengan suara tumpang tindih dari yatagarasu dan juga seorang dewasa Ruri, menyiratkan itu Naomi sendiri yang telah jatuh menuju dalam koma dari kecelakaan petir dan orang dewasa Ruri berusaha mentransfer Memori Naomi dari Alltale menuju dunia nyata.
Novel and Anime [Review] 